12/2026 F. s.
Metodické usmernenie
sekcie auditu a kontroly Ministerstva financií SR
č. MF/008524/2026-1411
k vnútornému kontrolnému systému
Schválila: Ing. Vladimíra Zacharidesová, generálna riaditeľka sekcie auditu a kontroly
1. ÚVOD - VNÚTORNÝ KONTROLNÝ SYSTÉM
Ministerstvo financií Slovenskej republiky (ďalej len MF SR) plní podľa § 3 písm. f) zákona č. 357/2015 Z. z. o finančnej kontrole a audite a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov (ďalej len zákon č. 357/2015 Z. z.) úlohy Centrálnej harmonizačnej jednotky pre systém verejnej vnútornej kontroly v Slovenskej republike. Sekcia auditu a kontroly MF SR vypracovala Metodické usmernenie sekcie auditu a kontroly Ministerstva financií SR č. MF/008524/2026-1411 k vnútornému kontrolnému systému (ďalej len metodické usmernenie), ktoré je určené pre všetky orgány verejnej správy1.
Metodické usmernenie vychádza z princípov rámca COSO (Committee of Sponsoring Organisations of the Treadway Commission2a zohľadňuje požiadavky na systém vnútornej kontroly formulované Európskou komisiou - Generálnym riaditeľstvom pre rozpočet (DG Budget) prostredníctvom konceptu Public Internal Control (PIC). Zároveň metodické usmernenie reflektuje odporúčania OECD uvedené v dokumente SIGMA č. 59 - Usmernenie k posúdeniu kvality systémov vnútornej kontroly3.
Metodické usmernenie obsahuje kritériá, ktoré je potrebné naplniť na účely vytvorenia a udržiavania kvalitného a funkčného vnútorného kontrolného systému v podmienkach verejnej správy v súlade so zákonom č. 357/2015 Z. z. Správne nastavený a funkčný vnútorný kontrolný systém má zabezpečiť najmä to, aby orgány verejnej správy nakladali s verejnými financiami hospodárne, efektívne, účinne a účelne.
Vnútorný kontrolný systém predstavuje súbor riadiacich, kontrolných a podporných opatrení, ktorých cieľom je zabezpečiť včasné, účinné a efektívne plnenie úloh a dosahovanie cieľov organizácie v súlade so stanovenými výkonnostnými štandardmi a v rámci stanoveného rozpočtu.
Správne nastavený vnútorný kontrolný systém má zabezpečiť prevenciu podvodov, korupcie a iných nezrovnalostí, zabezpečenie ochrany verejných financií a včasnú identifikácia nedostatkov. To si vyžaduje vytvorenie primeraných systémových predpokladov v orgánoch verejnej správy, aby boli zistené nedostatky bezodkladne komunikované zodpovedným osobám a aby boli prijímané účinné nápravné opatrenia.
Súčasťou vnútorného kontrolného systému je aj zabezpečenie operatívneho odstraňovania nedostatkov zistených finančnou kontrolou, vnútorným auditom alebo inými kontrolnými a dozornými orgánmi. Zároveň je nevyhnutné jasne určiť zodpovednosť za zistené nedostatky a uplatňovať primerané opatrenia v súlade s platnými právnymi predpismi.
Na plnenie povinností súvisiacich s vnútorným kontrolným systémom by mal prioritne dohliadať útvar vnútorného auditu prostredníctvom vykonávania vnútorných auditov. V prípade, ak orgán verejnej správy nemá zriadený útvar vnútorného auditu, štatutárny orgán orgánu verejnej správy je oprávnený poveriť zamestnancov…